Het zeer spannende verhaal van Professor Layton en de Doos van Pandora voert spelers van puzzel naar puzzel. In totaal zijn er meer dan 150 nieuwe breinbrekers, raadsels en logica puzzels om op te lossen. In tegenstelling tot de voorganger is het spel in z'n geheel naar het Nederlands vertaald. Zo kan elke speler het verhaal en de puzzels zonder moeite begrijpen. Naast de teksten in beeld zijn ook de tekenfilmpjes en gesproken dialogen geheel in het Nederlands. Dit keer gaan Professor Layton en Luke op reis om de mysterien te ontrafelen rondom de plotselinge dood van Dr. Schrader, de vriend en mentor van Professor Layton. Tijdens hun onderzoek vinden ze naast het lichaam van Dr. Schrader een treinkaartje voor de Molentary Express. Vreemd genoeg staat er geen bestemming op het kaartje, dus hebben ze geen idee waar deze luxe trein hen naartoe zal brengen. Aan jou de taak om het duo voorbij de talrijke puzzels te helpen en te achterhalen wie of wat verantwoordelijk is voor de dood van Dr. Schrader. Kan de mysterieuze Doos van Pandora er iets mee te maken hebben? Net als tijdens zijn vorige avontuur, draagt de professor weer een merkwaardige koffer vol verrassingen met zich mee. Dit keer zitten er drie nieuwe minigames in: "Camera", "Hamster" en "Theedoos." In de minigame "Camera" moet de speler de onderdelen van een kapotte camera verzamelen om hem weer te herstellen. Eenmaal gerepareerd, kan de camera gebruikt worden om foto's te maken van verdachte locaties. Dit keer krijgt het duo ook een hamster onder hun hoede! In zijn eigen minigame "Hamster", kun je voor hem een trainingsparkoers samenstellen. Met de minigame "Theedoos" kan de speler drie ingredienten in de theepot stoppen om een ontspannende thee te zetten. Niet alle combinaties zijn een succes, maar een goede pot thee kan in veel situaties van pas komen. Naast de vele puzzels in het verhaal, kunnen spelers ook extra puzzels downloaden via de Nintendo Wi-Fi Connection. Volgend op de lancering van het spel, zal gedurende een bepaalde periode elke week een nieuwe puzzel beschikbaar komen. Andere extra's zijn een mysterieus gesloten dagboek, speciale uitdagingen en een bonussectie. Trouwe fans van de serie kunnen een speciaal password uit Professor Layton and the Curious Village gebruiken om met een bijzondere puzzel beloond te worden. Met een spannend nieuw verhaal vol mysterien, gesproken dialogen en tal van tekenfilmpjes, behoudt dit nieuwe deel de sfeer en charme van de voorganger, maar wordt de ervaring verrijkt met een heleboel nieuwe content en frisse uitdagingen. Een must-have voor iedere Nintendo DS(i)-bezitter.