Het is al een week geleden sinds de wereld iets heeft gehoord van het kleine Oost Europese koninkrijk Villtania. Langzaam druppelen er verhalen binnen van Villtaniaanse vluchtelingen. De verhalen gaan over een verschrikkelijke verwoesting door monsters. Deze zijn opgeroepen door Raimond, de belangrijkste geleerde en tovenaar van Villtania die een oorlog begint om de macht te krijgen over de wereld.

De Verenigde Naties hebben een wereldwijde noodtoestand afgeroepen, maar ze kunnen geen legers naar dit vreemde bovennatuurlijke conflict sturen. Daarom loven ze een enorme beloning uit aan de huurmoordenaars en jagers die dapper genoeg zijn om deze monsters uit een andere dimensie te bevechten. Zij moeten de rust weer doen wederkeren in Villtania. Krijgers komen vanuit overal in de wereld om voor gerechtigheid of geld oorlog te gaan voeren op het slagveld van Villtania.

Guilty Gear Judgment combineert de snelle arcadegameplay van Guily Gear X2 Reload met nieuwe gameplay. Deze nieuwe gameplay bestaat uit de Boost Modus. Dit is een tweedimensionale beat-em-up met twintig Guilty Gear-personages. Elk hebben ze hun eigen verhaallijn en kunnen ze meerdere routes kiezen in de 19 levels. Ook hebben ze vele special moves die we al eerder zagen in Guilty Gear-games zoals Psych Burst, Dust Attack en Roman Cancel. Voor de eerste keer is het bovendien mogelijk om de hordes aanvallers met zijn tweeën te trotseren.