Begin aan een geheel nieuw avontuur op de mysterieuze Cloudbreak eilanden, waar een mystieke vulkaan staat die om honderd jaar uitbarst. Tijdens een epische strijd zit er een moedige groep Skylanders gevangen op het eiland tijdens een uitbarsting van de vulkaan. Door de kracht van de vulkaan worden ze uiteen en afzonderlijk naar de Aarde geblazen. Maar de magie van de vulkaan gaf deze helden een opmerkelijke nieuwe kracht: de mogelijkheid om van lichaamshelften te wisselen. Nu vormen zij een speciaal team bekend als de Swap Force.